Entre los años 2015 y 2022 el Tren Interurbano, denominado "El Insurgente" acumuló observaciones por más de dos mil 500 millones de pesos por parte de la Auditoría Superior de la Federación (ASF).
La obra iniciada por el gobierno de Enrique Peña Nieto y heredada a la administración de Andrés Manuel López Obrador registró la mayor parte de observaciones durante la gestión del priista, por cuestiones como pagos indebidos, pagos en exceso, montos por aclarar, obras de mala calidad, entre otros.
De hecho la obra se encareció en relación con lo que se tenía programada y los trabajos se atrasaron, pues iniciaron en 2014 y se planeaba que concluyeran en 2017 con una inversión de más de 30 mil millones, pero apenas en 2023 fue inaugurada la primera etapa y se estima una inversión total de 94 mil millones.
Mientras en 2015 se observaron 132.9 millones, para 2016 fueron 137 millones de pesos de pagos en exceso, en 2017 sumaron 745.4 millones, en 2018 se observaron 220 millones en la primera entrega, otros 586 en la segunda y 38.7 en la tercera
Para 2019 se señalaron 269.9 millones de pagos indebidos, en 2020 sumaron 357.7 millones, en el 2021 otros 72 millones y en la primera entrega del 2022 se observaron 10 millones.
2015
En el año 2016 se dió a conocer la primera auditaría a las obras del tren interurbano México Toluca en el informe de resultado de la fiscalización de la cuenta pública 2015
Hubo observaciones por 132 millones 907 mil pesos correspondientes a recuperaciones probables, otros 4.4 millones por aclarar y se determinó que las autoridades federales y capitalinas no evaluaron correctamente las ofertas de los concursantes y no obtuvieron las mejores condiciones técnicas y económicas ni se obtuvo la totalidad de la liberación de los derechos de vía.
Además, la ASF determinó pagos indebidos por 137 millones 307 mil pesos por servicios en obras que se encontraban suspendidas o no habían iniciado, incumplimiento a las especificaciones de construcción y a los alcances de precios unitarios, diferencia de volúmenes entre obra pagada y ejecutada entregada y ejecutada.
2016
En la segunda entrega de la cuenta pública 2016 se determinaron pagos indebidos por mil 775 millones 319 mil pesos por diferencias entre volúmenes pagados y cuantificados en el proyecto, falta de comprobación de que los recursos suministrados y no devengados se hubieran reintegrado la tesorería; también por el pago de gastos recuperables, sin verificar que fueran debidamente comprobados y registrados en bitácora.
Otros pagos fueron indebidos por la improcedencia de precios unitarios fuera de catálogo, por pagos a la empresa encargada de asesoría control y seguimiento sin verificar que el gobierno de la Ciudad de México fue el encargado de llevar la logística, administración y planeación.
Asimismo, por incumplimientos de los alcances y términos de referencia de las empresas y por pagar conceptos fuera de catálogo que se duplicaron; además de pagos a la proyectista y la incorrecta integración del análisis del costo de financiamiento.
2017
Para el Informe de la cuenta 2017 también se determinaron pagos indebidos por 745 millones 476 mil pesos por no utilizar los criterios establecidos en el contrato para disgregar los trabajos, por no acreditar los desperdicios del precio fuera de catálogo, por incluir personal y equipo de laboratorio cuando ya estaban contemplados en los alcances contractuales y la supervisión.
También por la incorrecta autorización de una segunda planta de dovelas, por no respetar los costos básicos establecidos en el contrato, no acreditar el suministro de refacciones, por intereses generados en el pago de refacciones no suministradas, por la incorrecta integración de precios, por mala calidad en el piso elevado para el exterior, por la adquisición de predios fuera del derecho de vía y sin documentación soporte.
Asimismo por el pago de días domingo a personal de asesoría ya incluido en la integración del salario real, por diferencia de volúmenes en las cantidades de obra pagada, por autorizar pagos que no se relacionaban con el programa de construcción del proyecto y por trabajos de mala calidad en talleres y cocheras.
2018
En la primera entrega de la Cuenta 2028 hubo pagos indebidos por la incorrecta integración de precios fuera de catálogo, por diferencias de volúmenes y mala calidad en ejecución de trabajos, por pagar el ajuste de costos indirectos sin acreditar que la contratista permanecía en el sitio de los trabajos hasta la fecha de la conclusión, por no aplicar sanciones a la contratista.
También por no respetar los costos básicos de concurso en varios conceptos, por diferencias de volúmenes en los trabajos de excavación de túneles, trabajos de mala calidad, por duplicidad de actividades de la supervisión externa.
En la segunda entrega también hubo pagos indebidos por no acreditar el arrendamiento de tres predios, no acreditar el pago para la adquisición de individuos en los trabajos de reforestación, por la duplicidad de pagos de domingos y días festivos, por pagar actividades distintas al objeto del contrato, por cubrir obras de mitigación social que no cumplían con el objeto del proyecto.
En la tercera entrega hubo pagos indebidos por la integración de conceptos no previstos en el catálogo original por considerar gastos que se realizan por única vez al inicio de la obra y no debieron considerarse en la actualización y trabajos de banquetas de concreto hidráulico del estacionamiento con fisuras o fragmentos desprendidos.
2019
Este año hubo pagos improcedentes por deficiencias en la ejecución de los trabajos en la rampa de emergencia del edificio administrativo del complejo de talleres y cocheras y la incorrecta integración de precios unitarios fuera de catálogo.
También por considerar costos básicos de precios unitarios establecidos en el contrato, por no acreditar el cambio en categorías de la mano de obra, por considerar cobros por obras de maquinaria en espera cuya actividad se duplica, no comprobar la elaboración de informes de supervisión, no acreditar el incremento en la plantilla de personal y las actividades de filmación no cumplieron con el tiempo establecido.
Asimismo, por pagar trabajos de reinyección en ambos túneles cuando fueron para corregir deficiencias, por pagar trabajos de demoliciones a la contratista, actividades de asesoría técnica especializada para atención de problemas sociales sin que se acreditarán dichas actividades por el pago de actividades que no corresponden con el objeto del contrato.
En la tercera entrega también se determinaron pagos improcedentes por la incorrecta integración de precios unitarios para afirmaciones a las supervisión externa sin tomar en cuenta que no cumplía con los tiempos mínimos requeridos, duplicidad de pago domingos y festivos y horarios nocturnos, pero no se presentó comprobación para acreditarlo.
Además, se advirtió que no se habían obtenido todos los derechos de vía.
2020
En la cuenta 2020 también hubo pagos indebidos por gastos no recuperables por suspensiones de obra y ajustes de costos por no verificar el cálculo se haya ajustado lo establecido por la incorrecta integración de conceptos por pagar volúmenes mayores a los ejecutados.
También por pago de ajustes de costos, diferencias de volúmenes en trabajos de reinyección en túneles, por pagar trabajos a la contratista; así como por integrar conceptos no previstos en el catálogo original para trabajos correctivos y ajustes de obra mal ejecutada, pagar vigilancia y seguridad cuando ya estaba considerado en costo indirecto.
Asimismo, por pagar conceptos no previstos en el catálogo original, no contar con el soporte de ejecución de turnos pagados, trabajos con deficiencias en soldadura, duplicidad del pago y ajuste de costos en los días domingos y festivos.
2021
En el informe de la Cuenta 2021 también hubo montos por aclarar por pagos en exceso en conceptos extraordinarios por actualización de costos, la incorrecta integración de un concepto extraordinario, por pagar cuatro conceptos extraordinarios de supervisión de trabajos, también por pagos en exceso por concepto de actualización del ajuste de costo por diferencias en cantidades de maquinaria y equipo, así como de mano de obra a costo directo e indirecto por turnos nocturnos turnos mayores a ocho horas y otros en domingo.
2022
En los informes de la cuenta 2022 la ASF encontró posibles daños al erario por 10 millones 40 mil 516 pesos en las obras de la construcción de la Estación Vasco de Quiroga por pagos en exceso y la principal causa probable de la irregularidad fue la falta de supervisión en la ejecución de los contratos.
